从总体上看，迪庆生物产业迈出了新的步伐，取得了令人欣喜的成绩。在“十一五”期间，我州生物产业的发展目标已由追求生物业产品数量向稳定总量、优化质量转变，但生物产业整体发展水平还很低，“资源型、原料型、趋同性”的状况还未根本改变，龙头企业规模小、产品知名度和科技含量低，农业基础设施脆弱等状况还未根本改变。存在的问题主要表现在： 

 （一）产业化水平低

迪庆州生物产业处于朝阳产业的成长阶段，尚未实现向专业化、标准化、适度规模化和集约化生产和经营的根本转变。生产规模小，缺乏专业化分工，产业链条不能有机衔接、协调一致。

（二）科技水平低，专业人才缺乏

科技人才不足，缺乏有力的科技支撑体系，缺乏具有自主知识产权和市场竞争力的产品及相应配套技术。科技培训及推广体系尚未形成，致使产品科技含量低，市场竞争乏力。

（三）资金投入明显不足，产业启动速度慢

由于我州财力薄弱，对生物产业的投入明显不足。在生物产业的培育过程中，基地建设、发展名特优新生物产品、品牌培育、产品精深加工和市场开拓等都需要大量资金投入，特别是加工型龙头企业和一些种养大户资金短缺的问题比较突出。

（四）社会化服务体系不健全

农户与龙头企业、龙头企业和中介组织之间关系松散，未能有效形成产、供、销一体化的生产经营体系，还未形成规范、完善的技术服务体系，没有形成利益共享、风险共担、共同发展的整体，在不同程度上挫伤了群众发展生物产业的积极性。

（五）市场营销体系不健全

迪庆生物产业市场发育程度低，在省内外市场占有份额较少，尚无较稳定完善的销售网络，经营规模小而分散，形不成统一品牌，加上远离中心城市，受交通条件制约，交易成本高。

（六）基地建设滞后，规模效益不明显

乡镇之间产业化基地建设还不平衡，大部分乡镇尚没有形成自己各具特色的产业基地。同时，基地种植（养殖）和管理技术缺乏，还未形成一套符合当地实际的行之有效的种植管理技术，规模效益始终得不到显现。